OrgaCount - Einstellungen



OrgaCount ist eine sehr flexible Anwendung, die in vielen Bereichen individuell angepasst werden kann, so zum Beispiel beim Zähllayout und Tastaturlayout, bei den Artenlisten und den Biovolumen.




Zähllayout


In OrgaCount sind eine Reihe von benutzerfreundlichen Zähllayouts voreingestellt, die für die Anforderungen aus verschiedenen Projekten und für unterschiedliche Benutzer angepasst werden können.

Das Zähllayout beinhaltet eine Liste der Zählobjekte (Taxa, Größenklassen oder Zählobjekte, die keine Organismen sind), die während einer Zählsitzung erfasst werden. Jedes Objekt umfasst eine Reihe von notwendigen Zählinformationen: den Namen des Taxons, Details bezüglich der zugehörigen Größenklasse (bei vordefinierten Größenklassen), den zugewiesenen Tastaturcode, eine Textbox mit dem Zählwert und andere Kontrollelemente für die individuelle Zähleinstellung.




OrgaCount enthält mehrere Designvorlagen ('Templates'), die für die individuelle Anpassung der Elemente im Zähllayout ausgewählt werden können. Zwischen den Vorlagen kann jederzeit hin und her geschaltet werden, sogar mitten in einer Zählung, ohne dass das Zählprogramm neu gestartet werden muss.

Im oberen Bild wird eine Vorlage gezeigt, die kleine Taxon-Icons beinhaltet. Diese Funktion erleichtert das Auffinden von Elementen im Zähllayout und hilft neuen Anwendern dabei, sich schnell mit verschiedenen taxonomischen Objekten vertraut zu machen. Diese Bild-Icons können mit der Hochladefunktion ('Upload images') in das Programm hoch geladen werden. Die Bilder können verschiedene Formate haben und leicht in das Zähllayout eingefügt werden.







Die folgende Liste gibt einen Überblick über die Funktionen und Vorteile der flexiblen Zähllayouts:
  • Es gibt eine Auswahl benutzerfreundlicher Zähllayouts
  • Die Liste der Zähllayouts kann entsprechend den Bedürfnissen der Benutzer erweitert werden
  • Die Zähllayouts sind als HTML-Vorlagen angelegt ('design templates')
  • Sie können auch durch Personen mit weniger ausgeprägten Computerkenntnissen angepasst werden
  • Die Zähllayouts können jederzeit während einer Zählsitzung gewechselt werden, ein Neustart des Programms oder der Zählung ist nicht erforderlich
  • Für ein Zählobjekt können folgende Eigenschaften für das Zähllayout festgelegt bzw. genutzt werden:

    • ein Icon, dessen Größe in der Vorlage festgelegt wird
    • den Namen und die Größenklasse des Taxons
    • die Tastaturbelegung
    • den Zählwert für Taxon oder Größenklasse
    • den Zählfaktor
    • die Auszählfläche (Streifen, Kammer, Quadrat etc.)
    • ein Link zur Anpassung der Zähloberfläche für
      • den CF-Tag (auf der Taxon- und Größenklassenebene)
      • das 'Einfrieren' des Zählstatus und die verwendete Taste
    • ein Auswahlknopf, der ein Fenster zur Bestimmung der Biovolumen öffnet (bei Ad-Hoc-Zählungen)

  • Wenn für ein Zählobjekt mehr als eine Größenklasse festgelegt ist, öffnet sich ein Fenster mit einer Liste der Zählgrößenklassen (Biovolumen- oder Zähl-Popup)
  • OrgaCount hat einen Voll-Bildschirmmodus, in dem fast alle Zählobjekte im sichtbaren Bildschirmbereich angezeigt werden. Ein Scrollen des Bildschirms ist dann nicht erforderlich. Die Objekte können zur besseren Lesbarkeit auch vergrößert werden, falls der Bildschirm vom Mikroskop weiter entfernt steht. Im Voll-Bildschirmmodus sind andere Details nicht sichtbar, so dass der Anwender sich ausschließlich auf seine Zählungen konzentrieren kann.




Tastaturlayout



OrgaCount ermöglicht die Verwendung verschiedener Tastaturlayouts, die sich im Wesentlichen durch länderspezifische Einstellungen unterscheiden. In Abhängigkeit von der Landesprache können verschiedene Tasten oft nicht verwendet werden. Es kann daher vorteilhaft sein, auf ein anderes Tastaturlayout zu wechseln, um mehr Tasten für den Zählprozess zur Verfügung zu haben.
Nicht belegte Tasten werden mit einer weißen Hintergrundfarbe angezeigt. Verwendete Tasten sind blau unterlegt. Wenn es Tasten gibt, die im aktuellen Zähllayout verwendet werden, aber mit dem voreingestellten Tastaturlayout nicht eingesetzt werden können, werden diese rot markiert. Auf diese Weise ist jederzeit schnell ersichtlich, welche Tasten für die Zählung zur Verfügung stehen.

Das Tastaturlayout kann jederzeit während der Zählung geändert werden und beeinträchtigt nicht die Ergebnisse der laufenden Zählung.




Die Vorlage und das Tastaturlayout werden automatisch von den vorherigen Zählsitzungen oder aus der Voreinstellung von OrgaCount übernommen. Außerdem können Sie auswählen, ob Sie die existierenden Einstellungen behalten wollen oder sie individuell anpassen.

Die Haupteigenschaften des Tastaturlayouts:
  • Der Zählvorgang kann ausgeführt werden, indem wahlweise mit der Maus auf die entsprechenden Knöpfe in der Programmoberfläche geklickt wird oder durch Drücken der vorbelegten Tasten auf der Tastatur
  • Das System kann verschiedene Tastaturlayouts abspeichern
  • Das Tastaturlayout kann zu jedem Zeitpunkt der Zählung geändert werden, ohne dass die Ergebnisse beeinträchtigt werden
  • Tasten, die im aktuellen Tastaturlayout nicht zur Verfügung stehen, sind im Programm farblich markiert
  • Zählobjekte, für die keine Tasten festgelegt wurden, sind deutlich markiert
  • Es existieren Design-Vorlagen wie unter Zähllayout beschrieben.




Zähllisten und -objekte


Das Modul 'Zähllisten' verbindet das Zähllayout mit den Zählobjekten, normalerweise Taxa und/oder Größenklassen. Die Auswahl der Taxa für das Zähllayout werden in virtuellen Ablagen gehalten, die Zähllisten ('Counting lists') genannt werden. OrgaCount erlaubt die Verwaltung multipler Zähllisten, einschließlich der Erstellung neuer Listen und der Modifizierung bestehender Listen. Während einer Zählung kann jederzeit zwischen verschiedenen Zähllisten hin- und hergeschaltet werden, so dass sich die Anzahl der Taxa und/oder Größenklassen, die gleichzeitig gezählt werden können, beliebig erhöhen lässt. Die Zähllisten können jederzeit für andere Proben wieder verwendet werden.

Eine sehr vielseitig einsetzbare Eigenschaft von OrgaCount ist die Möglichkeit, im Zähllayout Taxa und Größenklassen gleichzeitig zur Verfügung zu haben und so die Anzahl der verwendeten Zählobjekte zu erhöhen: Ein und dasselbe Taxon kann verschiedenen Größenklassen zugewiesen werden. Wenn eines dieser Objekte gezählt wird, öffnet sich automatisch ein Größenklassenfenster, in dem die Größenklasse ausgewählt werden kann.

Die Zähllisten sind leicht zugänglich, in dem die entsprechende Ebene unter der aktuellen Zählung ('Current session') geöffnet wird.





Das sich für die Zähllisten öffnende Fenster ist im Wesentlichen in zwei Bereiche aufgeteilt: Eine Taxonliste, die für die Zählung ausgewählt wird, findet sich auf der linken Seite des Fensters.
Auf der rechten Seite sieht man eine Liste mit allen Arten, die für den aktuellen Zählmodus zur Verfügung stehen. Diese Liste umfasst sowohl die Taxonnamen wie die Urheberschaft ('Authorship') und hat darüber hinaus eine Suchfunktion, um Taxa nach alphabetischer Reihenfolge zu suchen:





Wenn Zähllisten definiert sind, können sie aus einer Auswahlliste oben links übernommen werden. OrgaCount lädt dann die Objekte der gewählte Liste in das Zähllayout und in der linken Fensterseite in die aktuelle Zählliste.





Die folgende Aufstellung gibt eine Übersicht über die Eigenschaften des Zähllisten-Moduls:
  • Die Objektliste in der Zähloberfläche kann sowohl Taxa als auch Größenklassen enthalten
  • Die Objektliste in der Zähloberfläche (mit Taxa oder Größenklassen) kann jederzeit durch Hinzufügen oder Löschen von Arten geändert werden, auch während der Zählung
  • Bei der Auswahl von Zählobjekten in der Programmoberfläche werden vorhandene Zähldaten zu dem Taxon oder der Größenklasse sofort angezeigt, wenn sie aus der gleichen Zählung oder aus dem gleichen Projekt stammen
  • Wenn mit festgelegten Größenklassen gearbeitet wird, ermittelt das Programm automatisch, ob ein Taxon nur eine Größenklasse hat und fügt diese dem Zähllayout hinzu.
  • Ferner sind Funktionen vorhanden für

    • eine Taxonsuche (alphabetisch)
    • die Auflistung von festgelegten Größenklassen
    • das Hinzufügen neuer Taxa
    • das Hinzufügen neuer Größenklassen
    • das Löschen von Größenklassen
    • die Erstellung neuer Objektlisten

  • Eine Objektliste kann mit jedem Zähllayout verwendet werden
  • Der Anwender kann spezielle Listen seiner Wahl erstellen und während der Zählung jederzeit hin- und herschalten
  • OrgaCount hat eine Tab-Ansicht für die Taxonlisten und zugehörige Größenklassen. Diese Liste kann auch direkt editiert werden oder nach Excel exportiert werden. Die Tab-Ansicht bietet außerdem Filterfunktionen für Taxonnamen, Datum der Eingabe von Taxa sowie für Größenklassen. Die Filterlisten können ebenfalls nach Excel exportiert werden




Biovolumen-Popup


Das Biovolumen-Popup is ein Modul, das die Definition von Größenklassen während des Zählprozesses erlaubt. In diesem Rahmen werden aus hinterlegbaren statistischen Informationen die Biovolumen eines Taxon in der Probe berechnet.
Die meisten Taxa haben eine bestimmte geometrische Form. Das ist nicht der Fall für manche höhere Taxa, die in mehr als einer geometrischen Form vorkommen können. In diesem Fall kann dem Taxon eine geometrische Form zugeordnet werden. Dazu wird das Biovolumen-Popup durch Klicken auf das 'V' neben dem Taxonnamen im Zähllayout geöffnet:





Das Biovolumen-Popup enthält die folgenden Elemente:
  • den Taxonnamen
  • ein Diagramm, das den geometrischen Körper des Taxons und Messdaten anzeigt
  • die Bezeichnung des geometrischen Körpers und die entsprechende Berechnungsformel
  • eine Eingabemaske zur Berechnung der Zelldimensionen des Taxons
  • eine Liste der vermessenen Objekte
  • verschiedene statistische Anwendungen für die Berechnung des Biovolumens, generiert aus den Zellvermessungen

Wenn dem Taxon keine geometrische Form zugeordnet ist, gibt es eine weitere Alternative: Durch Klicken auf den 'V'-Button öffnet sich eine Auswahlliste.





Im Feld, das mit 'Tags' gekennzeichnet ist, kann nun zusätzliche Information eingegeben werden, die auch im Zähllayout angezeigt wird.


Im Folgenden werden die Eigenschaften der Biovolumen-Popups kurz aufgelistet:

  • Wenn mit festgelegten Größenklassen gezählt wird, zeigt das Zähl-Popup automatisch eine Größenklassenliste für jedes Taxon
  • Die 'Größenklassen-Taste' kann durch Klicken in der Programmoberfläche oder durch Drücken einer vorbelegten Taste ausgelöst werden
  • Das Zählfenster für festgelegte Größenklassen beinhaltet eine Liste mit Taxonnamen, Größenklassenbereich, Zähleinheit, Bezeichnung des volumetrischen Körpers, verschiedene Messwerte, berechnete Biovolumen und Kohlenstoffwerte
  • Im Ad-hoc-Zählmodus steht ein Modul zur Berechnung von Biovolumen und Statistiken zur Verfügung. Das Modul zeigt die Bezeichnung für den geometrischen Körper, die Berechnungsformel sowie die Messgrößen, die zur Berechnung erforderlich sind
  • Das Modul erlaubt die Festlegung von Tasten für Größenklassenzählungen
  • Mit einer Größenklassenzählung werden automatisch alle statistischen Berechnungen durchgeführt:

    • Zählen der Größenklassenverteilung
    • Berechnung der Durchschnittsmessung für jede Dimension
    • Berechnung des Biovolumens für jede einzelne Größenklasse
    • Berechnung des Durchschnittsvolumens aller Größenklassen
    • Berechnung des Durchschnittsvolumens für alle Werte und Zählungen

  • Die volumetrischen Formeln können in der Datenbank angepasst und ergänzt werden
  • Biovolumen können während einer Zählung oder hinterher berechnet werden




System


OrgaCount ist ein sehr anwenderfreundliches und leicht zu benutzendes System. Auch die technische Einrichtung und Einstellung ist einfach und bietet viele Installationsmöglichkeiten. Im Folgenden wird ein kurzer Überblick gegeben.

Technische Information

OrgaCount ist eine Webanwendung, die in einer Serverumgebung läuft. Hierbei wird Technologie eingesetzt, die auf verschiedenen Betriebssystemen lauffähig ist, einschließlich verschiedener Versionen von Linux und Windows. Das Programm läuft vorzugsweise auf einem AquaEcology-Server und kann so kontinuierlich gewartet und aktualisiert werden. Die zugehörige Datenbank wird automatisch regelmäßig gesichert. Die Installation und der Betrieb von OrgaCount erfolgt durch einen sicheren Port (https), um einen optimalen Schutz der Login-Informationen wie auch der Daten zu gewährleisten. Alternativ kann OrgaCount auch auf einem Kundenserver oder in einer lokalen PC-Umgebung installiert werden. Das Programm läuft von Festplatte, vom USB-Stick oder SD-Karte.

Die lokale Installation von OrgaCount setzt einen lokalen ApacheServer mit PHP and MySQL ein, aber es benötigt unter Windows keine zusätzlichen Installationen. Die von OrgaCount verwendete Datenbank basiert auf MySQL, das eins der schnellsten und verlässlichsten Datenbanksysteme auf dem Markt ist. Alle Daten, die durch das Programm erzeugt werden, können jederzeit zugänglich gemacht werden, auch durch externe Programme und Tools.

Voraussetzungen

Um die webbasierte Version von OrgaCount zu verwenden, wird lediglich ein Standard-Webbrowser benötigt. Die Anwendung ist für Firefox 3 oder höher sowie für Google Chrome 8 oder höher optimiert. Der Internet Explorer 7 und höher sowie Opera 10 und höher wurden ebenfalls getestet, können aber in bestimmten Bereichen Einschränkungen bei der Darstellung haben. Grundsätzlich läuft das Programm aber auch mit anderen Webbrowsern. Wir empfehlen Firefox, der zurzeit kostenfrei als zuverlässiger Browser zur Verfügung steht.

Anwender-/ User-System

Die webbasierte Version von OrgaCount kann von verschiedenen Usern gleichzeitig bedient werden. Standardnutzer können allerdings nur ihre eigenen Daten einsehen, während Projektadministratoren auch die Daten von anderen Gruppen desselben Projektes bearbeiten können. Um OrgaCount zu verwenden, brauchen Sie sich nur in der Eingangsseite mit Ihrem Usernamen einzuloggen. Die Einstellungen der Software sind anwenderspezifisch und ermöglichen dem Benutzer, sich sein eigenes Arbeitsumfeld individuell einzurichten.


Menü Einstellungen






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